財政部臺北市國稅局表示，公司組織之營利事業，會計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用藍色申報或經會計師查核簽證，並如期申報者，得自全年所得額扣除經稽徵機關核定之前5年各期虧損後，再行核課。但違章情節重大者，不適用所得稅法有關前5年虧損扣除之規定；惟若漏報所得稅額不超過新台幣10萬元或短漏報課稅所得額占全年所得額之比例不超過5﹪，且非以詐術或其他不正當方法逃漏稅捐，得視為情節輕微，仍適用前揭規定。
該局說明，查核某公司營利事業所得稅案件時，發現公司無進貨事實而取得虛設行號發票，短漏報所得額280餘萬元、稅額70餘萬元，且其漏報課稅所得額超過全年所得額5﹪，致申報自全年所得額扣除之前5年虧損扣除額計3,000餘萬元均否准認列，遭補稅800餘萬元，並予以處罰。
該局呼籲，營利事業應確實依所得稅法規定列報成本、費用，並依規定取得合法憑證，以免因違章而無法適用盈虧互抵規定，遭到補稅及處罰。
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